6月11日，日本文部科學省等部門發布調查結果稱，東京福祉大學的“學部研究生”（即本科預科生）等留學生約1600人下落不明，認為“大學的責任重大”，要求暫停接納預科生，并考慮減少和停發該大學的私立學校補助金。要求大學徹底做好留學生的學籍管理，顯示出制止非法滯留和違法務工的明確姿態。

據日經中文網6月12日消息，3月，東京福祉大學有大量留學生下落不明一事被曝光，文部科學省等展開了調查。調查結果顯示，該大學近年來迅速擴大接納留學生。2016~2018年度接納了約1.2萬名留學生，其中有1610人下落不明，700人退學，178人被開除學籍。

該大學的留學生除了社會福祉系等正規課程之外，還有學習日語和日本文化的留學生別科、正規課程預備階段的本科預科生等。

在預科生中，日語能力低的學生和無力支付學費的學生很多。但是，該大學沒有配備與學生規模相適應的職員，對于缺課學生的指導不夠充分。下落不明者的7成是預科生，因此文部科學省要求其暫停招收預科生。

為防止同樣問題再次發生，日本文部科學省宣布將制定新制度，不允許留學生學籍管理不當的大學招收留學生。

在新制度之下，各大學必須每月向文部科學省報告下落不明、退學和開除學籍的留學生人數。如果指導之后仍未改善，文部科學省將作為“學籍管理不當大學”通報給法務省。法務省在大學做出改善之前，將停止向新入學學生給予留學在留資格。

在以往的制度下，非法滯留者較多的大學將被認定為“慎重審查對象學校”、加強其在留資格的審查。舊制度也將被修訂，如果連續3年成為慎重審查對象學校，將停止給予在留資格。此外，還將公布大學名，處以減少和停發私立學校補助金等處罰。文部科學省將敲定制度的詳細內容，在2019年度內修改省令等。

文部科學省將通過新制度，在各大學以正規課程以外的課程招收留學生時，確認學生是否具備相當于大學入學的日語能力。針對留學生別科，將制定確保教員人數等資質的新標準。

報道稱，日本政府提出留學生達到30萬人的計劃，一直在積極接納留學生。截至2018年度的留學生總數比5年前增加約13萬人，為約29.9萬人。另一方面，非法滯留的留學生出現激增，截至2019年1月達到4708人。