9月16日0—24時，31個省(自治區、直轄市)和新疆生產建設兵團報告新增確診病例9例，均為境外輸入病例(上海4例，陜西2例，河南1例，廣東1例，云南1例)；無新增死亡病例；新增疑似病例1例，為境外輸入病例(在上海)。

當日新增治愈出院病例11例，解除醫學觀察的密切接觸者728人，重癥病例較前一日增加1例。

境外輸入現有確診病例141例(其中重癥病例1例)，現有疑似病例1例。累計確診病例2674例，累計治愈出院病例2533例，無死亡病例。

截至9月16日24時，據31個省(自治區、直轄市)和新疆生產建設兵團報告，現有確診病例141例(其中重癥病例1例)，累計治愈出院病例80448例，累計死亡病例4634例，累計報告確診病例85223例，現有疑似病例1例。累計追蹤到密切接觸者824740人，尚在醫學觀察的密切接觸者6496人。

31個省(自治區、直轄市)和新疆生產建設兵團報告新增無癥狀感染者14例(均為境外輸入)；當日無轉為確診病例；當日解除醫學觀察21例(均為境外輸入)；尚在醫學觀察無癥狀感染者354例(境外輸入353例)。

累計收到港澳臺地區通報確診病例5530例。其中，香港特別行政區4984例(出院4663例，死亡102例)，澳門特別行政區46例(出院46例)，臺灣地區500例(出院477例，死亡7例)。